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洁净厂房建筑设计具有很强的综合性。建筑设计是为生产与生活筹划室内、外空间的工作，借以寻求空间功能合理、造型美观、经济耐用的综合效果。洁净厂房建筑设计则着重为了净化而去解决各项洁净技术专业分类在应用工程中的统筹安排。以获得最优化综合效果的空间，特别是洁净室的建筑设计与空气净化设计，两者在空间布局与气流组织、建筑气密与微正压控制等方面有着密切的关系，做好上述设计工作能保证洁净室内密性和洁净度的要求。
(1)一般规定
1)洁净厂房的建筑平面和空间布局，应具有适当的灵活性。
2)洁净区的主体结构不宜采用内墙承重。
3)洁净室的高度以净高控制，净高应以100mm为基本模数。
4)洁净厂房主体结构的耐久性与室内装备和装修水平相协调，并应具有防火、控制温度变形和不均匀沉陷的性能(地震区应符合抗震设计规定。
5)厂房变形缝应避免穿过洁净区。
6)送、回风管和其他管线需暗敷时，应设置技术夹层、技术夹道或地沟等。
7)穿越极层的竖向管线需暗敷时，宜设置技术竖井。
8)对兼有一般生产和洁净生产的综合性厂房，其方案设计和构造的处理，应避免在人流与物流运输以及防火方面对洁净生产带来不利影响。
(2)人员净化和物料净化设施
1)洁净厂房内应设置人员净化、物料净化用室和设施，并应根据需要设置生活用室和其他用室。
2)人员净化用室，宜包括雨具存放间、管理室、换鞋室、存外衣室、盥洗室、洁净工作服室和空气吹淋室等。
3)厕所、淋浴室、休息室等生活用室，以及工作服清洗间和干燥间等其他用室，可根据需要设置。
4)人员净化用室和生活用室，应符合下列要求：
①人员净化用室的入口处，应设净鞋器。
②存外衣室和洁净工作服室应分别设置。
③外衣存衣柜和洁净工作服柜应按编制人数每人设一柜。
④盥洗室应设洗手和烘干设备。
⑤水龙头应按最大班人数每10人设置一个。
⑥洁净区不得设厕所。
⑦人员净化用室内的厕所应设前室。
⑧空气吸淋室应设在洁净区人员入口处，并应与洁净工作服室相邻。
⑨单人空气吹淋室按最大班人数每30人设一台。
⑩当仅为100级垂直层流洁净室时，可改设气闸室。
⑩洁净区工作人员超过5人时，空气吹淋室一侧应设旁通门。
5)人流路线应避免往复交叉。
6)根据不同的空气洁净度等级和工作人员数量，洁净厂房内人员净化用室和生活用室的建筑面积应合理确定。一般可按洁净区设计人数平均每人4。6rri2计算。
7)洁净工作服室内，对空气净化应有一定的要求。
8)洁净室的设备和物料出入口，应根据设备和物料的性质、形状等特征设置物料净化用室及其他设施。
9)物料净化用室的布置，应防止净化后物料在传递过程中被污染。
